Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Vamp8O70404 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp8O70404 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vamp8O70404 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms