Protein–RNA interactions for Protein: O55233

Cer1, Cerberus, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cer1O55233 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cer1O55233 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cer1O55233 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cer1O55233 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cer1O55233 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cer1O55233 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cer1O55233 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cer1O55233 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cer1O55233 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cer1O55233 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cer1O55233 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cer1O55233 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cer1O55233 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cer1O55233 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cer1O55233 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cer1O55233 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cer1O55233 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cer1O55233 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms