Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rad51dO55230 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad51dO55230 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad51dO55230 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad51dO55230 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms