Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tlx3O55144 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlx3O55144 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlx3O55144 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tlx3O55144 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tlx3O55144 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlx3O55144 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlx3O55144 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlx3O55144 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlx3O55144 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tlx3O55144 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlx3O55144 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tlx3O55144 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx3O55144 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx3O55144 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx3O55144 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx3O55144 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tlx3O55144 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlx3O55144 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlx3O55144 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlx3O55144 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlx3O55144 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlx3O55144 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlx3O55144 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tlx3O55144 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tlx3O55144 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlx3O55144 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tlx3O55144 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlx3O55144 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tlx3O55144 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx3O55144 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx3O55144 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlx3O55144 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlx3O55144 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx3O55144 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx3O55144 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms