Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sdc4O35988 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sdc4O35988 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sdc4O35988 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdc4O35988 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms