Protein–RNA interactions for Protein: O35949

Elovl3, Elongation of very long chain fatty acids protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elovl3O35949 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Elovl3O35949 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Elovl3O35949 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Elovl3O35949 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms