Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnfrsf18O35714 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnfrsf18O35714 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnfrsf18O35714 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnfrsf18O35714 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms