Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2888K7N746 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm2888K7N746 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2888K7N746 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2888K7N746 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms