Protein–RNA interactions for Protein: K7N724

Gm3453, Predicted gene 3453, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3453K7N724 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm3453K7N724 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm3453K7N724 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3453K7N724 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms