Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm379J3QQ19 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm379J3QQ19 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm379J3QQ19 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm379J3QQ19 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms