Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20828J3KMI7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20828J3KMI7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm20828J3KMI7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm20828J3KMI7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm20828J3KMI7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm20828J3KMI7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm20828J3KMI7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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