Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cldn34aG3UW52 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cldn34aG3UW52 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cldn34aG3UW52 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms