Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NpcdF8VQB8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NpcdF8VQB8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NpcdF8VQB8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NpcdF8VQB8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NpcdF8VQB8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NpcdF8VQB8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NpcdF8VQB8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NpcdF8VQB8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NpcdF8VQB8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NpcdF8VQB8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NpcdF8VQB8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NpcdF8VQB8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms