Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pcdh11xF6ZNL5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcdh11xF6ZNL5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcdh11xF6ZNL5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms