Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4933403O08RikF6UK53 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933403O08RikF6UK53 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4933403O08RikF6UK53 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4933403O08RikF6UK53 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms