Protein–RNA interactions for Protein: F6TVX7

Gm20671, Predicted gene 20671 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20671F6TVX7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm20671F6TVX7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20671F6TVX7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm20671F6TVX7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm20671F6TVX7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.2 ms