Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q2

R3hdm1, R3H domain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm1E9Q9Q2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
R3hdm1E9Q9Q2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
R3hdm1E9Q9Q2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
R3hdm1E9Q9Q2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
R3hdm1E9Q9Q2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms