Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc146E9Q9F7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc146E9Q9F7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc146E9Q9F7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc146E9Q9F7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms