Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ythdc1E9Q5K9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ythdc1E9Q5K9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ythdc1E9Q5K9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ythdc1E9Q5K9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ythdc1E9Q5K9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1067.7 ms