Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3C1

C2cd2, C2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd2E9Q3C1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C2cd2E9Q3C1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2cd2E9Q3C1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2cd2E9Q3C1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2cd2E9Q3C1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2cd2E9Q3C1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2cd2E9Q3C1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C2cd2E9Q3C1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C2cd2E9Q3C1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C2cd2E9Q3C1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C2cd2E9Q3C1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms