Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610021A01RikE9Q0Q3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610021A01RikE9Q0Q3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610021A01RikE9Q0Q3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610021A01RikE9Q0Q3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610021A01RikE9Q0Q3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610021A01RikE9Q0Q3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610021A01RikE9Q0Q3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610021A01RikE9Q0Q3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms