Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Fndc1E9Q043 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Fndc1E9Q043 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Fndc1E9Q043 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Fndc1E9Q043 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Fndc1E9Q043 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Fndc1E9Q043 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fndc1E9Q043 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Fndc1E9Q043 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Fndc1E9Q043 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Fndc1E9Q043 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Fndc1E9Q043 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Fndc1E9Q043 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fndc1E9Q043 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fndc1E9Q043 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fndc1E9Q043 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fndc1E9Q043 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Fndc1E9Q043 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Fndc1E9Q043 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fndc1E9Q043 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Fndc1E9Q043 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms