Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc62E9PVD1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc62E9PVD1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc62E9PVD1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc62E9PVD1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms