Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim5E9PV98 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim5E9PV98 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim5E9PV98 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim5E9PV98 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim5E9PV98 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms