Protein–RNA interactions for Protein: E9PUS4

Zfp944, Zinc finger protein 944, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp944E9PUS4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Zfp944E9PUS4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp944E9PUS4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp944E9PUS4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp944E9PUS4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp944E9PUS4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Zfp944E9PUS4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Zfp944E9PUS4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Zfp944E9PUS4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Zfp944E9PUS4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zfp944E9PUS4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp944E9PUS4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zfp944E9PUS4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms