Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Piezo1E2JF22 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Piezo1E2JF22 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Piezo1E2JF22 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Piezo1E2JF22 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms