Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm4491E0CX42 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gm4491E0CX42 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm4491E0CX42 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm4491E0CX42 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm4491E0CX42 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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