Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vpreb3D3Z6J4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Vpreb3D3Z6J4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms