Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
Abcc8B2RUS7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC46.26■■■■■ 5
Abcc8B2RUS7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
Abcc8B2RUS7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
Abcc8B2RUS7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
Abcc8B2RUS7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
Abcc8B2RUS7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Abcc8B2RUS7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
Abcc8B2RUS7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC46.22■■■■■ 4.99
Abcc8B2RUS7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Abcc8B2RUS7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC46.21■■■■■ 4.99
Abcc8B2RUS7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
Abcc8B2RUS7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
Abcc8B2RUS7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
Abcc8B2RUS7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
Abcc8B2RUS7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC46.18■■■■■ 4.98
Abcc8B2RUS7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC46.18■■■■■ 4.98
Abcc8B2RUS7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC46.17■■■■■ 4.98
Abcc8B2RUS7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC46.17■■■■■ 4.98
Abcc8B2RUS7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC46.16■■■■■ 4.98
Abcc8B2RUS7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC46.15■■■■■ 4.98
Abcc8B2RUS7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC46.14■■■■■ 4.98
Abcc8B2RUS7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Abcc8B2RUS7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC46.14■■■■■ 4.98
Abcc8B2RUS7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Abcc8B2RUS7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
Abcc8B2RUS7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC46.13■■■■■ 4.98
Abcc8B2RUS7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
Abcc8B2RUS7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
Abcc8B2RUS7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
Abcc8B2RUS7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
Abcc8B2RUS7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.08■■■■■ 4.97
Abcc8B2RUS7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Abcc8B2RUS7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
Abcc8B2RUS7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
Abcc8B2RUS7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC46.06■■■■■ 4.96
Abcc8B2RUS7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Abcc8B2RUS7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Abcc8B2RUS7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
Abcc8B2RUS7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
Abcc8B2RUS7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
Abcc8B2RUS7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
Abcc8B2RUS7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
Abcc8B2RUS7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
Abcc8B2RUS7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
Abcc8B2RUS7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
Abcc8B2RUS7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
Abcc8B2RUS7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
Abcc8B2RUS7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC45.98■■■■■ 4.95
Abcc8B2RUS7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
Abcc8B2RUS7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
Abcc8B2RUS7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
Abcc8B2RUS7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC45.96■■■■■ 4.95
Abcc8B2RUS7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
Abcc8B2RUS7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC45.96■■■■■ 4.95
Abcc8B2RUS7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC45.96■■■■■ 4.95
Abcc8B2RUS7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
Abcc8B2RUS7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
Abcc8B2RUS7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC45.95■■■■■ 4.95
Abcc8B2RUS7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC45.94■■■■■ 4.94
Abcc8B2RUS7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
Abcc8B2RUS7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC45.93■■■■■ 4.94
Abcc8B2RUS7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
Abcc8B2RUS7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
Abcc8B2RUS7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC45.92■■■■■ 4.94
Abcc8B2RUS7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC45.92■■■■■ 4.94
Abcc8B2RUS7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC45.91■■■■■ 4.94
Abcc8B2RUS7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC45.91■■■■■ 4.94
Abcc8B2RUS7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.9■■■■■ 4.94
Abcc8B2RUS7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.89■■■■■ 4.94
Abcc8B2RUS7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Abcc8B2RUS7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Abcc8B2RUS7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
Abcc8B2RUS7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC45.88■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC45.87■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC45.86■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC45.86■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC45.86■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC45.85■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC45.84■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC45.83■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
Abcc8B2RUS7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.81■■■■■ 4.92
Abcc8B2RUS7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Abcc8B2RUS7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Abcc8B2RUS7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Abcc8B2RUS7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC45.8■■■■■ 4.92
Abcc8B2RUS7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC45.79■■■■■ 4.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms