Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Otud7bB2RUR8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Otud7bB2RUR8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Otud7bB2RUR8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud7bB2RUR8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud7bB2RUR8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud7bB2RUR8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud7bB2RUR8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Otud7bB2RUR8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Otud7bB2RUR8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Otud7bB2RUR8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Otud7bB2RUR8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Otud7bB2RUR8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Otud7bB2RUR8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Otud7bB2RUR8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Otud7bB2RUR8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud7bB2RUR8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Otud7bB2RUR8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms