Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usf3B2RUQ2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usf3B2RUQ2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usf3B2RUQ2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms