Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba1B2RUJ5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba1B2RUJ5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Apba1B2RUJ5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Apba1B2RUJ5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms