Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prrt4B2RU40 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prrt4B2RU40 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prrt4B2RU40 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prrt4B2RU40 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms