Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nipsnap3aB1AWZ3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms