Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox1B1APN4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox1B1APN4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox1B1APN4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox1B1APN4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rhox1B1APN4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox1B1APN4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox1B1APN4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox1B1APN4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox1B1APN4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rhox1B1APN4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox1B1APN4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox1B1APN4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox1B1APN4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox1B1APN4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rhox1B1APN4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhox1B1APN4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rhox1B1APN4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rhox1B1APN4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rhox1B1APN4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhox1B1APN4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhox1B1APN4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhox1B1APN4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhox1B1APN4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhox1B1APN4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhox1B1APN4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhox1B1APN4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms