Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Odf2A3KGV1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Odf2A3KGV1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Odf2A3KGV1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms