Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syndig1A2ANU3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Syndig1A2ANU3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Syndig1A2ANU3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Syndig1A2ANU3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms