Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FocadA2AKG8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FocadA2AKG8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FocadA2AKG8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FocadA2AKG8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FocadA2AKG8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms