Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRH6

Zscan4-ps3, Zinc finger and SCAN domain containing 4, pseudogene 3, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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Zscan4-ps3A0A1B0GRH6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
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