Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GRE8

Zscan4e, Zinc finger and SCAN domain-containing 4E, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan4eA0A1B0GRE8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
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Zscan4eA0A1B0GRE8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Zscan4eA0A1B0GRE8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Zscan4eA0A1B0GRE8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Zscan4eA0A1B0GRE8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Zscan4eA0A1B0GRE8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Zscan4eA0A1B0GRE8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Zscan4eA0A1B0GRE8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zscan4eA0A1B0GRE8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zscan4eA0A1B0GRE8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms