Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIT1

Ccdc194, Coiled-coil domain-containing protein 194, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc194A0A140LIT1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc194A0A140LIT1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc194A0A140LIT1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc194A0A140LIT1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc194A0A140LIT1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc194A0A140LIT1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc194A0A140LIT1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc194A0A140LIT1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc194A0A140LIT1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc194A0A140LIT1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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