Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Larp1bA0A0A6YXJ7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Larp1bA0A0A6YXJ7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Larp1bA0A0A6YXJ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Larp1bA0A0A6YXJ7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Larp1bA0A0A6YXJ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms