Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kif3aP28741 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kif3aP28741 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms