Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933424G06RikA0A140LIP3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933424G06RikA0A140LIP3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.6 ms