Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Kif3aP28741 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3aP28741 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 287.4 ms