Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5538W4VSP6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5538W4VSP6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm5538W4VSP6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5538W4VSP6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5538W4VSP6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5538W4VSP6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5538W4VSP6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5538W4VSP6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5538W4VSP6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5538W4VSP6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5538W4VSP6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5538W4VSP6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5538W4VSP6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5538W4VSP6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5538W4VSP6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5538W4VSP6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5538W4VSP6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5538W4VSP6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms