Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gm28036V9GXJ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm28036V9GXJ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm28036V9GXJ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gm28036V9GXJ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms