Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D6

Mecp2, Methyl-CpG-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mecp2Q9Z2D6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mecp2Q9Z2D6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mecp2Q9Z2D6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mecp2Q9Z2D6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mecp2Q9Z2D6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mecp2Q9Z2D6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mecp2Q9Z2D6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mecp2Q9Z2D6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mecp2Q9Z2D6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mecp2Q9Z2D6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mecp2Q9Z2D6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms