Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn7Q9Z261 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn7Q9Z261 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn7Q9Z261 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms