Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ddx39bQ9Z1N5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx39bQ9Z1N5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx39bQ9Z1N5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms